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《自然》揭開“癌王”的生存秘密,奇特DNA讓癌細胞不僅瘋長還善變

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▎藥明康德內(nèi)容團隊編輯

以胰腺導(dǎo)管腺癌(PDAC)為主的胰腺癌,是目前最致命的癌癥之一,確診患者的5年生存率只有13%。因為致死率高,胰腺癌也常被稱為“癌癥之王”。這一方面是因為胰腺癌發(fā)展早期很難被發(fā)現(xiàn),等到確診往往為時已晚。另一方面,胰腺癌還有極強的適應(yīng)性,對化療藥物、靶向藥物等治療手段都會產(chǎn)生耐藥性。


圖片來源:123RF

本周,在《自然》新發(fā)表的一篇論文中,來自意大利維羅納大學(xué)(University of Verona)、英國格拉斯哥大學(xué)(University of Glasgow)和葡萄牙Botton-Champalimaud胰腺癌中心的研究人員聯(lián)手揭開了“癌王”不為人知的秘密。

他們發(fā)現(xiàn),這些癌細胞通過一類特殊的DNA獲得了重要的生存優(yōu)勢。這種DNA游離于染色體之外,具有奇特的環(huán)狀結(jié)構(gòu),被稱為染色體外DNA(ecDNA)。


其實在過去十年里,已經(jīng)有越來越多的研究者注意到ecDNA喜歡在癌細胞里“搞鬼”。2014年,《科學(xué)》雜志上的一篇論文發(fā)現(xiàn),癌細胞里存在這種不同尋常的ecDNA,會讓癌細胞發(fā)生快速變異。后續(xù)研究指出,,幫助腫瘤快速生長,并對環(huán)境快速做出反應(yīng),產(chǎn)生耐藥性。

2024年,有研究者對數(shù)萬個腫瘤樣本分析后發(fā)現(xiàn),在各種類型的癌癥中,ecDNA的出現(xiàn)頻率遠比過去以為得高,而且除了致癌基因外,上面還可能包含了增強子序列,通過“組合拳”讓癌細胞獲得生存優(yōu)勢。這些發(fā)現(xiàn)也讓一些科學(xué)家想到了全新的抗癌方向:靶向ecDNA消滅癌細胞。

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那么在胰腺癌中,ecDNA充當(dāng)了什么角色?靶向ecDNA的策略是否能應(yīng)用于胰腺癌的治療?在此次專門針對胰腺癌的新研究中,科學(xué)家們展開了詳細的探索。

根據(jù)論文的描述,研究者從近40份患者原發(fā)腫瘤中提取細胞并在體外培養(yǎng)為三維的類器官,以便充分保留腫瘤本身的基因構(gòu)成,進而通過全基因組測序檢查細胞內(nèi)的ecDNA。研究人員重點檢查了CDKN24、TP53、SMAD4、KRAS、MYC等經(jīng)典PDAC基因的拷貝數(shù),因為這些基因的拷貝數(shù)變異已被充分證明是胰腺癌發(fā)生的主要驅(qū)動因素。


▲分析源自PDAC患者腫瘤細胞構(gòu)建的類器官,顯示ecDNA驅(qū)動MYC等癌基因大量擴增(圖片來源:參考資料[1])

與其他癌癥研究一致的是,在相當(dāng)一部分患者的樣本中出現(xiàn)了ecDNA。而在這些ecDNA攜帶的致癌基因中,作者發(fā)現(xiàn),通過ecDNA使拷貝數(shù)擴增最為明顯的是經(jīng)典癌基因MYC。

研究人員發(fā)現(xiàn),有些細胞的ecDNA攜帶的MYC拷貝數(shù)可能多達幾十到上百,給癌細胞提供了極大的生長優(yōu)勢。但即使在同一個腫瘤內(nèi),細胞之間也存在很大差異,有一些細胞的MYC拷貝數(shù)則很少,顯現(xiàn)出了胰腺癌特有的瘤內(nèi)異質(zhì)性。根據(jù)研究人員的解釋,不同細胞亞群的共存可能就是胰腺癌在治療中極容易產(chǎn)生耐藥性的重要原因。


▲一些腫瘤細胞內(nèi)的ecDNA有上百個MYC基因拷貝(圖片來源:參考資料[1])

接下來,研究人員進一步利用模擬患者腫瘤的類器官,測試了ecDNA是如何幫助癌細胞快速適應(yīng)生存環(huán)境的。當(dāng)他們在培養(yǎng)類器官的環(huán)境中撤除了一種支持生長的分泌蛋白(例如WNT蛋白),那些含有數(shù)十到數(shù)百個ecDNA的癌細胞“脫穎而出”,能夠在不利于生長的環(huán)境下繼續(xù)存活。在這種情況下,作者觀察到基于ecDNA的MYC會迅速增加表達。

此外,ecDNA還會幫助癌細胞改變形態(tài)和行為。作者發(fā)現(xiàn),隨著成千上萬的ecDNA在癌細胞內(nèi)積累,MYC拷貝數(shù)飆升,癌細胞從原來的腺樣結(jié)構(gòu)變成了更具侵襲性的實體結(jié)構(gòu)?!拔覀冎?,胰腺癌的致命性一部分來源于腫瘤細胞在壓力下的‘形變’能力,現(xiàn)在,研究結(jié)果表明,ecDNA是其中的重要部分?!闭撐墓餐ㄓ嵶髡逷eter Bailey博士在新聞稿中指出。


MYC含量高(紅色所示)的細胞往往會出現(xiàn)較高的DNA損傷(綠色所示),表明過多的MYC會導(dǎo)致基因組壓力。(圖片來源:參考資料[2];Credit:Vincenzo Corbo Lab)

令人意外的是,實驗結(jié)果顯示,當(dāng)環(huán)境壓力消失,癌細胞還會減少ecDNA,降低MYC的表達。這一現(xiàn)象打破了過去“MYC對于癌細胞多多益善”的印象。

研究者推測,由于MYC的過高表達會引發(fā)DNA損傷,ecDNA一味增加反而會使癌細胞付出健康代價,因此ecDNA或許對于癌細胞來說也是一把“雙刃劍”。而如果是這樣的話,研究人員可以設(shè)法打破ecDNA在癌細胞中的“平衡”,利用ecDNA開發(fā)對付癌王的新對策。

參考資料:

[1] Elena Fiorini et al., MYC ecDNA promotes intratumour heterogeneity and plasticity in PDAC. Nature (2025) Doi: https://doi.org/10.1038/s41586-025-08721-9

[2] The secret DNA circles fueling pancreatic cancer’s aggression. Retrieved Mar. 12, 2025 from https://www.eurekalert.org/news-releases/1076314

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