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IRAK4:兩大巨頭又開始battle了!

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引言:Gilead跟Sanofi又~雙~叒~叕~杠上了

上次寫STAT6 靶點時就發(fā)現(xiàn)這兩個公司喜歡在“炎癥信號”領(lǐng)域“較勁”!

這次研究IRAK4 靶點,發(fā)現(xiàn)這倆大公司又前后腳進(jìn)入了同一領(lǐng)域。


賽諾菲和Kymera合作 VS 吉利德和Nurix合作!

在炎癥領(lǐng)域賽諾菲因為度普利尤單抗,可以說是排頭兵。而吉利德,除了在HIV領(lǐng)域內(nèi)獨領(lǐng)風(fēng)騷,在炎癥領(lǐng)域幾乎存在感不強(qiáng)。

看上去,一個想招兵買馬,擴(kuò)大地盤,而另一個想“揭竿而起”,殺入別人的“炎癥”腹地!


IRAK4全稱白細(xì)胞介素-1受體相關(guān)激酶4,是一種絲/蘇氨酸激酶,屬于IRAK家族,是先天免疫TLR/IL-1R通路中間的關(guān)鍵蛋白。

它的功能不僅是激酶(磷酸化下游蛋白),同時還是裝配信號復(fù)合體“Myddosome”的“支架”蛋白,這兩個角色共同把炎癥信號推向下游(NF-κB、MAPK)。

也正是它的一人雙面,使得傳統(tǒng)小分子“抑制劑”不能夠起到預(yù)期的作用。

這些抑制劑大多只“堵住激酶活性”,但I(xiàn)RAK4的“支架”功能照舊,真的是“按著葫蘆瓢起”!

因此,IRAK4的抑制劑在臨床中效果有限。


如,PF-06650833在類風(fēng)濕關(guān)節(jié)炎(RA)中顯示了一定療效,但在化膿性汗腺炎(HS)的II期試驗中與安慰劑相比無顯著差異。

此外,拜耳開發(fā)的Zabedosertib(BAY1834845)用于中重度特應(yīng)性皮炎(AD)的II期臨床試驗(NCT05656911)已終止。


如何解決這個問題?其實非常簡單粗暴,解決不了問題的,就解決出現(xiàn)問題的蛋白!

這時候蛋白降解劑(PROTAC)技術(shù)就有了用武之地了!

通過給IRAK4蛋白貼上“識別標(biāo)簽”,招募E3泛素連接酶,打上“泛素”,最終送進(jìn)“蛋白粉碎機(jī)”(蛋白酶體)徹底清除IRKA4。


隨著IRKA4蛋白被摧毀,其激酶功能和支架功能一起消失,自然的炎癥通路就被打斷了。

這也符合PROTAC技術(shù)的特點:靶向“難成藥”蛋白,尤其是胞內(nèi)蛋白,并徹底清除蛋白分子。

近期,多款I(lǐng)RAK4降解劑被開發(fā),其中KT-474 在I期臨床取得積極結(jié)果,成為首個進(jìn)入人體研究的候選物化合物。(和STAT6、IRF5一樣,IRKA4也是多種炎癥相關(guān)疾病的靶點)


01

IRAK4靶點介紹

IRAK4是TLR與白細(xì)胞介素-1受體(IL-1R)信號中的關(guān)鍵分子,參與TLR/IL-1R介導(dǎo)的MyD88依賴性通路。

除TLR3外,所有TLR/IL-1R家族成員都利用MyD88蛋白C端的TIR結(jié)構(gòu)域募集下游蛋白,MyD88含有Death Domain,可招募IRAK4。

MyD88?IRAK4復(fù)合體隨后招募IRAK4的底物IRAK2和IRAK1,形成左手螺旋寡聚體,即Myddosome信號復(fù)合物,由6個MyD88、4個IRAK4、4個 IRAK1分子組成。


TLR/IL-1R的激活使IRAK4激酶區(qū)彼此靠近,通過交叉自磷酸化激活,隨后磷酸化IRAK1。

IRAK4激酶可直接促使干擾素調(diào)節(jié)因子(IRF)進(jìn)入細(xì)胞核以轉(zhuǎn)錄炎癥信號分子。

此外,IRAK1的C端延伸部位含Pro?Xaa?Glu,可與腫瘤壞死因子受體相關(guān)因子6(TRAF6)相互作用,TRAF6是TLR信號通路的重要蛋白,促進(jìn)免疫與炎癥反應(yīng)。


02

IRAK4結(jié)構(gòu)

IRAK家族包括IRAK1、IRAK2、IRAK3與IRAK4,其中IRAK4是TLR/IL-1R 信號通路的關(guān)鍵激酶。

所有IRAK家族成員都包含一個激酶結(jié)構(gòu)域、一個N端Death Domain,及一個連接肽鏈。


IRAK4的激酶結(jié)構(gòu)域呈典型的雙葉結(jié)構(gòu),ATP結(jié)合口袋位于兩葉之間。該激酶結(jié)構(gòu)域內(nèi)有三個自磷酸化位點:Thr342、Thr345、Ser346。

激酶結(jié)構(gòu)域N端的ATP結(jié)合口袋稱“前口袋(Front Pocket)”,具有獨特的激酶葉延伸特征,包含 Schellman 環(huán)、兩親性 α-螺旋、ASX 模體、ST 模體以及 C 端富甘氨酸環(huán)。


Schellman環(huán)高度暴露于溶劑,G188/G189骨架氨基與P184/I185羰基之間形成氫鍵。

值得注意的是,該環(huán)上的 I185 殘基緊鄰ATP結(jié)合位點,這一點將IRAK4與其他激酶區(qū)分開。

此外,IRAK4的N端還包含獨特的鉸鏈環(huán)與門衛(wèi)殘基Tyr262。Tyr262側(cè)鏈的大小與柔性通常決定ATP結(jié)合位點附近一個附加疏脂性子口袋(“后口袋,Back Pocket”)的存在。


03

疾病和藥物應(yīng)用

IRAK4 兼具激酶與支架功能,傳遞炎癥與免疫應(yīng)答信號,在 TLR 與 IL-1R 家族信號通路中發(fā)揮關(guān)鍵作用。其信號失調(diào)與多種炎癥性疾病和炎癥相關(guān)癌癥有關(guān),是治療自免與炎癥性疾病的理想靶點。

多種炎癥性疾?。喝玢y屑病、特應(yīng)性皮炎(AD)、化膿性汗腺炎(HS)、類風(fēng)濕(RA)、骨關(guān)節(jié)炎(OA)、膿毒癥/急性肺損傷、慢性腎病、動脈粥樣硬化。

炎癥相關(guān)腫瘤:如部分MyD88突變驅(qū)動的DLBCL,但單獨降解IRAK4可能不夠,需要“連環(huán)打擊”。


IRAK4是炎癥信號“總閘門+支架”,傳統(tǒng)抑制劑難以解決支架功能,導(dǎo)致療效有限。

PROTAC降解IRAK4 是一種顛覆的“換賽道”方法:把蛋白整體清掉,既斷激酶也拆支架,藥效更全面。

另外 ,PROTAC的小分子“口服蛋白降解劑”如能做到“生物藥般的療效與持久性”+“口服的便利與低成本”,那機(jī)會就非常之大了!


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