1865年，浩罕國軍官阿古柏抵達喀什噶爾，別看他身邊僅有八十多人，然而他卻在數(shù)年的時間里，就侵占了新疆大部分地區(qū)，并建立了所謂的“畢杜勒特汗國”，還自封為埃米爾。阿古柏統(tǒng)治這里十余年的時間，直到左宗棠、劉錦棠率軍西征，才將其徹底打敗。那么，最初只有數(shù)十人的阿古柏是如何侵占新疆的呢？

一、動亂

咸豐年間，內(nèi)地爆發(fā)了太平天國運動、捻軍起義，使得清朝的統(tǒng)治陷入危機之中。到了同治年間，西北也出現(xiàn)了問題，陜甘地區(qū)爆發(fā)“回亂”。內(nèi)地持續(xù)的動亂，使得清朝對新疆的管理出現(xiàn)了松動，而這里也受到陜甘的影響，從而釀成動亂。

1864年4月，庫車首先發(fā)生動亂，辦事大臣薩凌阿及其屬下被殺，亂軍推舉熱西定擔任首領。消息傳到烏魯木齊，都統(tǒng)平瑞派兵平叛，結果行至半路就潰散了。接著，烏魯木齊也出現(xiàn)動亂，亂軍沖入提督衙門，上萬兵民被殺。

之后，和田、葉爾羌、喀什噶爾等地均出現(xiàn)動亂，并建立起了割據(jù)政權。就連伊犁將軍的駐地惠遠城也在1866年陷落，“兵民死者數(shù)萬”。至此，烏魯木齊以東，只有巴里坤、哈密尚在清朝的控制之下，其余地區(qū)均由割據(jù)政權掌握。

二、宗教

新疆的紛亂局面，給了阿古柏機會，另外還有一點，他利用宗教因素，也起到了至關重要的作用。原來，新疆地區(qū)的“白山派”信徒們對和卓家族非常推崇。而和卓家族后裔，也利用這一點，不斷給清朝制造麻煩。

當時，割據(jù)喀什噶爾的亂軍首領思的克、金相印想利用和卓后裔的影響力，來發(fā)動“白山派”，于是派人前往浩罕國。當時，浩罕國派阿古柏率領數(shù)十人“護送”和卓的后裔布素魯克前往喀什噶爾。

思的克、金相印做夢也沒有想到，自己的行為無異于引狼入室。別看阿古柏只有數(shù)十人，但他利用和卓后裔的聲望，煽動起了大批的支持者，很快就掌控了喀什噶爾。因此，雙方走向決裂，而且爆發(fā)了沖突。

三、亂局

阿古柏這個人膽子很大，僅用100多騎兵就敢發(fā)起夜襲，一舉擊潰了思的克的數(shù)千人。在控制喀什噶爾后，阿古柏開始向新疆各地用兵。與此同時，浩罕國被俄國滅掉，一批人投奔阿古柏，從而壯大了他的力量。

在阿古柏扶持下，布素魯克于1865年4月建立了所謂的“哲德沙爾汗國”。1867年5月，阿古柏干脆自立為王，他還派人前往奧斯曼帝國尋求支持。之后，阿古柏又利用新疆紛亂的局面，派兵進入北疆，占領了許多地區(qū)。

那么此時的清朝為何沒有第一時間派兵平叛呢？前面已經(jīng)說過了，此時的陜甘地區(qū)也出現(xiàn)了動亂，清朝正調(diào)集兵馬平叛，而這里是進入新疆的主要通道，因此在沒有解決陜甘問題前，清廷沒有力量來對付阿古柏。