在異質(zhì)催化研究中,構(gòu)建具有目標(biāo)吸附性能的催化活性位點(diǎn)是實(shí)現(xiàn)高效催化劑設(shè)計(jì)的核心問題之一。近年來,盡管前向設(shè)計(jì)方法結(jié)合了高通量密度泛函理論(DFT)計(jì)算與機(jī)器學(xué)習(xí),已在揭示結(jié)構(gòu)—性能關(guān)系方面取得重要進(jìn)展,但要實(shí)現(xiàn)真正意義上的逆向設(shè)計(jì),即從目標(biāo)性能出發(fā)反推理想結(jié)構(gòu),尤其是在高熵合金(HEAs)等結(jié)構(gòu)復(fù)雜體系中,仍面臨顯著挑戰(zhàn)。傳統(tǒng)模型往往難以兼顧物理可解釋性、三維結(jié)構(gòu)敏感性和生成能力。
Fig. 1 | Overview of feature extraction, dataset construction, and workflow for energy prediction and interface design.
近日,北京大學(xué)深圳研究生院潘鋒教授、北京雁棲湖應(yīng)用數(shù)學(xué)研究院李京艷助理研究員、廈門大學(xué)鄭世勝特任副研究員等,提出了一種具有物理可解釋性的拓?fù)潋?qū)動(dòng)生成模型框架(PGH-VAEs),相關(guān)成果已發(fā)表于npj Computational Materials(2025, 11:147)。該研究通過引入“持續(xù)GLMY同調(diào)”(persistent GLMY homology, PGH)這一新型代數(shù)拓?fù)涔ぞ撸状螌?shí)現(xiàn)了在三維結(jié)構(gòu)層面精確表征催化活性位點(diǎn)的拓?fù)涮卣?,并以此為指?dǎo),實(shí)現(xiàn)性能導(dǎo)向的結(jié)構(gòu)生成。
Fig. 2 | Workflow for coordination and ligand feature extraction of active sites.
GLMY同調(diào)是由著名數(shù)學(xué)家丘成桐先生及其合作者提出的一類基于路徑復(fù)形(path complex)的同調(diào)理論,能夠有效刻畫有向、非對稱圖形的整體結(jié)構(gòu)特征,在處理非歐幾里得空間中的結(jié)構(gòu)建模任務(wù)中具有獨(dú)特優(yōu)勢。研究團(tuán)隊(duì)將GLMY同調(diào)及持續(xù)GLMY同調(diào)(PGH)引入材料結(jié)構(gòu)表征中,提取出反映活性位點(diǎn)微結(jié)構(gòu)差異的拓?fù)洳蛔兞?,并將其與元素配體信息相結(jié)合,構(gòu)建了雙通道的結(jié)構(gòu)表示方法,分別編碼局域配位效應(yīng)與遠(yuǎn)場調(diào)控效應(yīng)。
Fig. 3 | PGH-VAEs: encoding, generation, and prediction workflow.
模型采用變分自編碼器(VAE)架構(gòu),在半監(jiān)督學(xué)習(xí)機(jī)制下訓(xùn)練了一個(gè)可解釋的潛在空間。盡管訓(xùn)練數(shù)據(jù)僅包含約1159條經(jīng)DFT標(biāo)注的吸附能數(shù)據(jù),團(tuán)隊(duì)通過引入梯度提升回歸器(GBRT)擴(kuò)展數(shù)據(jù)標(biāo)簽,提升了潛空間學(xué)習(xí)的穩(wěn)定性與泛化能力。最終,PGH-VAEs在*OH吸附能預(yù)測中的平均絕對誤差為0.045 eV,達(dá)到當(dāng)前結(jié)構(gòu)生成模型的領(lǐng)先水平。
研究進(jìn)一步發(fā)現(xiàn),PGH拓?fù)涮卣髦械腂etti數(shù)與吸附性能之間具有顯著的線性相關(guān)性,特別是零維與二維特征(分別對應(yīng)原子連通性與局域空穴結(jié)構(gòu))對性能預(yù)測最為關(guān)鍵。這一發(fā)現(xiàn)不僅揭示了結(jié)構(gòu)敏感性背后的數(shù)學(xué)機(jī)制,也提升了生成模型的物理可解釋性。借助這一潛空間,模型成功生成了具有優(yōu)異吸附性能的結(jié)構(gòu)構(gòu)型,其中以Pt/Pd為橋位、遠(yuǎn)場以Ru原子調(diào)控的三原子組合被反復(fù)識(shí)別為最優(yōu)構(gòu)型。進(jìn)一步理論分析表明,Ru相較于Ir與Rh在調(diào)節(jié)d帶中心位置方面更具優(yōu)勢。
Fig. 4 | Demonstration of PGH-VAEs on active sites design and optimization.
基于模型生成結(jié)果,研究團(tuán)隊(duì)還提出了不同晶面下的最優(yōu)組分比例:在(111)晶面為Pt:Pd:Ru = 0.7:0.2:0.1,在(211)晶面為3:3:4。這一結(jié)論為實(shí)驗(yàn)工作者在實(shí)際催化劑合成中的成分設(shè)計(jì)與晶面選擇提供了定量指導(dǎo)。與傳統(tǒng)依賴大量DFT數(shù)據(jù)和高計(jì)算成本的催化劑篩選方法相比,PGH-VAEs框架具備更高的數(shù)據(jù)利用效率、結(jié)構(gòu)可解釋性和潛在的可擴(kuò)展性。該研究不僅為催化活性位點(diǎn)的逆向設(shè)計(jì)提供了新的思路,也展示了代數(shù)拓?fù)涔ぞ咴诓牧峡茖W(xué)前沿中的應(yīng)用潛力。
論文鏈接:
https://www.nature.com/articles/s41524-025-01649-8
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