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從“不可成藥”到精準(zhǔn)狙擊:KRAS抗癌藥物的50年破局之路

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編者按:

KRAS
作為癌癥中最常見的突變驅(qū)動(dòng)基因之一,因其蛋白表面缺乏可供小分子藥物結(jié)合的結(jié)構(gòu),被長(zhǎng)期貼上“不可成藥”靶點(diǎn)的標(biāo)簽。自從首次發(fā)現(xiàn)與癌癥的關(guān)聯(lián)以來,全球科學(xué)家在KRAS靶向治療領(lǐng)域的探索從未停歇,目前已有數(shù)款KRAS抑制劑獲批,為曾經(jīng)的“不可成藥”難題提供解決方案。長(zhǎng)期以來,藥明康德也一直通過為合作伙伴提供“一體化、端到端”的CRDMO賦能服務(wù),助力癌癥治療新藥的開發(fā),為更多患者點(diǎn)燃生命之光。本文將分享KRAS靶向藥物領(lǐng)域的發(fā)展歷程以及多項(xiàng)前沿進(jìn)展。

KRAS 的發(fā)現(xiàn)故事始于20世紀(jì)70年代,Michael Bishop博士與Harold Varmus博士通過研究雞體內(nèi)的Rous肉瘤病毒,首次發(fā)現(xiàn)

RAS
等癌基因的存在,并證實(shí)其與腫瘤發(fā)展相關(guān),這一成果讓他們共同獲得了1989年諾貝爾生理學(xué)或醫(yī)學(xué)獎(jiǎng)。1978年,Edward Scolnick博士團(tuán)隊(duì)在研究Kirsten肉瘤病毒時(shí),發(fā)現(xiàn)了另一種與腫瘤相關(guān)的
RAS
基因,并命名為“
KRAS
”(Kirsten RAS)。此后,
HRAS
NRAS
等癌癥相關(guān)基因陸續(xù)被鑒定,共同構(gòu)成
RAS
基因家族。這些基因通過復(fù)雜信號(hào)通路驅(qū)動(dòng)癌癥進(jìn)展,成為癌癥治療的重要靶點(diǎn)。


KRAS的“不可成藥”困境

由于KRAS蛋白表面過于“光滑”,缺乏傳統(tǒng)小分子藥物的結(jié)合“口袋”,其“不可成藥”困境曾困擾靶向藥物研發(fā)數(shù)十年。

2013年,轉(zhuǎn)機(jī)出現(xiàn)了。加州大學(xué)舊金山分校的Kevan Shokat團(tuán)隊(duì)發(fā)現(xiàn),KRASG12C突變會(huì)將原本的甘氨酸替換為含巰基的半胱氨酸,這一殘基為共價(jià)抑制劑提供了潛在結(jié)合位點(diǎn)。通過化學(xué)庫篩選,該團(tuán)隊(duì)找到能與

KRAS
G12C半胱氨酸共價(jià)結(jié)合的小分子, 并證實(shí)其可將突變蛋白鎖定在失活態(tài),進(jìn)而阻斷下游致癌信號(hào)。這一突破為KRAS靶向治療奠定了基礎(chǔ),此后安進(jìn)(Amgen)基于該機(jī)制研發(fā)的(sotorasib)以及Mirati的(adagrasib)陸續(xù)獲美國FDA批準(zhǔn)上市,成為首批獲批的KRAS靶向療法。

此后,為了克服耐藥性的限制,基于創(chuàng)新抑制策略的新一代KRAS抑制劑應(yīng)運(yùn)而生。例如, Revolution Medicines開發(fā)的(RMC-6291)通過同時(shí)結(jié)合KRAS G12C與伴侶蛋白cyclophilin A,阻斷了KRAS G12C與RAS效應(yīng)蛋白的結(jié)合,從而抑制下游信號(hào)傳導(dǎo)。在對(duì)非小細(xì)胞肺癌(NSCLC)患者的臨床試驗(yàn)中,該療法取得了積極數(shù)據(jù)。

除了KRAS特異性抑制策略,泛KRAS靶向也為更廣泛患者群體帶來希望。例如,紀(jì)念斯隆-凱特琳癌癥中心研究團(tuán)隊(duì)開發(fā)的可抑制24種常見

KRAS
突變中的18種;Revolution Medicines的泛RAS抑制劑在攜帶非
KRAS
G12C突變的肺癌和胰腺癌模型中展現(xiàn)出廣譜抗腫瘤活性,目前已進(jìn)入臨床開發(fā)階段。


圖片來源:123RF

破局KRAS G12D:創(chuàng)新療法的多維探索

當(dāng)G12C的研究逐漸走向成熟,研究者把目光投向更常見也更難對(duì)付的KRAS G12D。作為全球癌癥中最常見的突變之一,不同于G12C,G12D突變將甘氨酸替換為含羧酸基的天冬氨酸。天冬氨酸殘基反應(yīng)活性低且在蛋白暴露區(qū)域豐度高,傳統(tǒng)共價(jià)抑制劑設(shè)計(jì)策略對(duì)此無能為力。

近年來,隨著學(xué)術(shù)界對(duì)KRAS生物學(xué)機(jī)制的深入理解以及新型藥物技術(shù)的突破,針對(duì)KRAS G12D的治療策略也取得了顯著進(jìn)展。目前,多種創(chuàng)新技術(shù)策略正并行推進(jìn)。例如,安斯泰來的ASP-3082采用蛋白降解策略,通過招募E3泛素連接酶直接降解KRAS G12D蛋白,繞開了傳統(tǒng)抑制劑的設(shè)計(jì)瓶頸。該分子已在早期臨床中顯示出強(qiáng)效抗腫瘤活性,目前已進(jìn)入1期臨床開發(fā)階段。另一代表性分子(Revolution Medicines研發(fā))則采用分子膠原理,誘導(dǎo)KRAS G12D與CYPA 形成三元復(fù)合物,從而阻斷其與下游效應(yīng)蛋白的相互作用。在針對(duì)經(jīng)治胰腺導(dǎo)管腺癌患者的2期臨床試驗(yàn)中,RMC-9805實(shí)現(xiàn)了30%的客觀緩解率和80%的疾病控制率,展現(xiàn)出令人鼓舞的臨床潛力。


圖片來源:123RF

近日,一項(xiàng)研究通過設(shè)計(jì)能與一種細(xì)胞伴侶蛋白結(jié)合的小分子化合物,在RAS和細(xì)胞伴侶蛋白之間構(gòu)建了全新的蛋白質(zhì)相互作用界面。這一界面可選擇性增強(qiáng)抑制劑與G12D天冬氨酸殘基的共價(jià)結(jié)合,克服了天冬氨酸殘基反應(yīng)活性低的挑戰(zhàn),為靶向此類“難以成藥”氨基酸突變提供了全新范式。基于此開發(fā)的候選分子在多種

KRAS
G12D突變的臨床前模型中均誘導(dǎo)了深度且持久的腫瘤消退。

在體外研究中,候選分子在

KRAS
G12D突變細(xì)胞系中表現(xiàn)出強(qiáng)效的抗增殖作用,可顯著抑制ERK磷酸化。在體內(nèi)藥效學(xué)研究中,該分子在攜帶
KRAS
G12D突變的胰腺癌異種移植模型中表現(xiàn)出優(yōu)異的藥代動(dòng)力學(xué)和藥效學(xué)特征。單次口服給藥后,血漿暴露量呈劑量依賴性增加, 并能有效實(shí)現(xiàn)對(duì)KRAS G12D的共價(jià)結(jié)合。免疫組化分析進(jìn)一步證實(shí),藥物可有效阻斷致癌性RAS信號(hào)通路。

在小鼠模型中,該化合物在多數(shù)KRASG12D驅(qū)動(dòng)的腫瘤模型中誘導(dǎo)了腫瘤消退,其中在非小細(xì)胞肺癌、胰腺癌和胃癌模型中療效尤為顯著,并且整體安全性良好。值得一提的是,該化合物在顱內(nèi)移植模型中同樣可誘導(dǎo)顯著的腫瘤消退,提示其具備良好的血腦屏障穿透能力,為

KRAS
G12D突變腦轉(zhuǎn)移患者提供了潛在治療可能。論文指出,藥明康德為這項(xiàng)研究提供了賦能支持。

總體而言,這一策略顯著拓展了共價(jià)抑制劑可靶向的癌驅(qū)動(dòng)蛋白及其他相關(guān)致病蛋白的殘基類型,同時(shí)為開發(fā)新型靶向調(diào)控機(jī)制提供了重要思路,展現(xiàn)出廣闊的臨床應(yīng)用前景。期待這些前沿突破能為更多

KRAS
突變的癌癥患者帶來治療曙光。

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