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眾多研究使用的UK Biobank數(shù)據(jù)庫,都包含哪些數(shù)據(jù)?

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本文內(nèi)容整理自醫(yī)咖會《UK Biobank介紹及應(yīng)用研究》專欄,小咖針對該數(shù)據(jù)庫包含的數(shù)據(jù)進行了整理。正在考慮使用該數(shù)據(jù)庫的伙伴,可以點擊左下角“閱讀原文”查看完整視頻進一步了解。

UK Biobank(UKB)與常見的老齡化數(shù)據(jù)庫,比如中國健康與養(yǎng)老追蹤調(diào)查CHARLS和美國健康與營養(yǎng)調(diào)查NHANES不太一樣,UKB主要調(diào)查基線暴露情況與未來結(jié)局之間的關(guān)聯(lián),理解基因、生活方式、環(huán)境在疾病與健康中的相互作用

基線調(diào)查時,UKB全面收集了參與者的數(shù)據(jù)資料,包括人口學信息、生活方式、體育鍛煉、環(huán)境因素(空氣、綠化)等等,同時UKB通過鏈接健康記錄或者直接聯(lián)系參與者持續(xù)跟蹤健康數(shù)據(jù)、通過問卷調(diào)查獲取認知功能和心理健康狀況,此外還進行了血液、尿液等生物樣本的采集。

這些樣本的采集花費了大量的時間,同樣也獲得了豐富的信息。

常規(guī)調(diào)查



眼部數(shù)據(jù)


血液生化指標


代謝組學

UKB包含昂貴的靶向代謝組學數(shù)據(jù),以脂質(zhì)組學為主的定量數(shù)據(jù),生物標志物跨越多個代謝途徑,包括了14個亞類中的的脂蛋白和各種低分子量的代謝物。


蛋白組學

UKB與藥企合作,調(diào)查了5萬多名參與者的血漿蛋白質(zhì)組特質(zhì),擁有2000+NPX數(shù)據(jù),通過了嚴格質(zhì)檢,發(fā)布后可以直接使用


基因分型數(shù)據(jù)

近年孟德爾隨機化分析備受青睞,其所依賴的GWAS中的大量基因分型數(shù)據(jù)就來自于UKB。得益于超大樣本量的基因數(shù)據(jù),UKB多次登上《Nature》封面。UKB有45萬人的基因數(shù)據(jù)可供下載和使用,包括使用定制基因分型芯片850k SNPs插補基因信息90M SNPs。不同疾病和性狀的GWAS結(jié)果在持續(xù)公布。外顯子和全基因序列數(shù)據(jù)可以在UKB-RAP平臺使用分析。

影像數(shù)據(jù)

已有10萬人的影像數(shù)據(jù)可以下載使用。如果不會分析MRI圖像,UKB使用了先進的自動化機器學習算法,計算了數(shù)千個可以直接使用的圖像衍生表型,包括全腦體積、海馬體積等等。


健康相關(guān)結(jié)局

UKB健康結(jié)局并不是來源于自我報告,而是鏈接英國國家衛(wèi)生系統(tǒng)(NHS)數(shù)據(jù)庫進行實時更新(半年-1年進行一次更新),目前已有大量死亡、癌癥及其他健康結(jié)局數(shù)據(jù),通過ICD9和ICD10可以區(qū)分超過1000種疾病,預(yù)計未來會有更多的可用數(shù)據(jù),助力研究者獲得陽性結(jié)果。

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