在腫瘤免疫分析中，表達差異和生存分析是前提(表達有差異，差異影響表型)，相關(guān)分析是拓展，包括與病理分期、治療手段、年齡、種族、吸煙、突變、性別、共表達等因素的相關(guān)情況。免疫浸潤是近些年的熱點，從2018年免疫治療獲得諾獎，到2025年外周免疫抑制獲得諾獎，熱度不減。隨著免疫研究的不斷延伸、拓展，免疫和生信分析相互成就，助推生信和免疫研究更上一層樓。

純生信21天教程（可以操作的腫瘤免疫學(xué)）

在進行某個基因的免疫分析時，有的果朋友無從下手，主要是因為對腫瘤免疫認(rèn)識不足。因此，做免疫分析前，務(wù)必掌握腫瘤微環(huán)境和腫瘤免疫循環(huán)等概念，否則一頭霧水，或者斷章取義。免疫系統(tǒng)在腫瘤發(fā)生、發(fā)展和治療中都起著至關(guān)重要的作用。隨著大數(shù)據(jù)時代的到來，對腫瘤免疫特征進行綜合分析日臻成熟，這方面的代表包括張澤民、劉小樂等。

網(wǎng)址: https://cistrome.shinyapps.io/timer/

TIMER (Tumor Immune Estimation Resource)算法用常規(guī)轉(zhuǎn)錄組測序的數(shù)據(jù)分析常見各種免疫細胞在腫瘤微環(huán)境的浸潤情況，TIMER2.0版本更是將內(nèi)容條理化。好消息傳來，，TIMER也升級到3.0。

網(wǎng)址：https://compbio.cn/timer3/

腫瘤的差異分析

生存分析

突變分析

相關(guān)分析（基于表達）

富集分析

免疫分析，與免疫細胞浸潤之間的關(guān)系

免疫預(yù)后分析

免疫治療響應(yīng)與表達分析

免疫治療的差異分析火山圖和表格

免疫治療預(yù)后分析

免疫治療預(yù)測分析

個性化分析，需要上傳清潔數(shù)據(jù)

作者是李太文博士，四川大學(xué)華西口腔醫(yī)學(xué)院口腔基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)系碩導(dǎo)，生信大牛劉雪莉教授的博后，以第一作者參與TIMER、TIMER2.0、TISCH、TISCH2.0和HUSCH等在線平臺的開發(fā)。，李太文博士則回到母校，創(chuàng)建自己的實驗室。期待這對師徒繼續(xù)書寫傳奇！

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