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蘭州大學(xué)雷新響課題組Angew:巰基-烯烴光點(diǎn)擊化學(xué)在雙環(huán)肽高效合成與基因編碼肽庫(kù)構(gòu)建中的應(yīng)用

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近年來(lái),環(huán)肽因其卓越的高親和性、優(yōu)異的代謝穩(wěn)定性及其在靶向“難成藥”靶點(diǎn)方面的獨(dú)特優(yōu)勢(shì),逐漸成為藥物研發(fā)領(lǐng)域的研究熱點(diǎn)。噬菌體展示技術(shù)作為一種高效、便捷的篩選平臺(tái),已被廣泛應(yīng)用于肽類候選分子的發(fā)現(xiàn)。然而,如何在噬菌體展示平臺(tái)上實(shí)現(xiàn)高效的環(huán)肽文庫(kù)構(gòu)建與功能篩選,仍然面臨著顯著的挑戰(zhàn)。為克服這一瓶頸,亟需發(fā)展一種反應(yīng)操作簡(jiǎn)便、生物相容性良好、底物適用性廣泛且能夠提供精確位點(diǎn)選擇性的環(huán)化策略,以推動(dòng)環(huán)肽藥物的高效發(fā)現(xiàn)與應(yīng)用。

蘭州大學(xué)雷新響教授課題組近年來(lái)致力于針對(duì)潛在藥用靶點(diǎn)發(fā)掘活性環(huán)肽的研究,并在噬菌體展示多肽篩選領(lǐng)域開(kāi)展了相關(guān)探索,成功地將化學(xué)成環(huán)策略(以鄰苯二甲醛與異硫氰酸酯為主導(dǎo))及酶催化成環(huán)策略應(yīng)用于噬菌體展示平臺(tái)上(

New. J. Chem.
2022, 46, 10299;
Chem. Sci.
2024, 15, 11847;
ChemRxiv.
2024, DOI: 10.26434/chemrxiv-2024 zh6t7; J
. Am. Chem. Soc.
2025, 147, 35090)。近日,該團(tuán)隊(duì) 首次報(bào)道了將巰基-烯烴光點(diǎn)擊化學(xué)策略應(yīng)用于多肽的雙環(huán)化、噬菌體展示雙環(huán)肽文庫(kù)的構(gòu)建和疾病靶標(biāo)活性環(huán)肽的篩選中 ( Angew. Chem. Int. Ed. 2025, 64, e202518628)。這一創(chuàng)新性方法為多肽雙環(huán)化和環(huán)肽藥物的發(fā)現(xiàn)提供了全新的思路,拓展了環(huán)肽藥物研發(fā)的技術(shù)手段。

傳統(tǒng)的雙環(huán)肽構(gòu)建方法,如TBMB、TBAB和TATA,常因與親核性殘基發(fā)生競(jìng)爭(zhēng)性副反應(yīng),導(dǎo)致反應(yīng)效率下降、色譜分離困難,且在生物環(huán)境中的兼容性有限。基于鉍(III)的策略因其通過(guò)選擇性配位與三個(gè)半胱氨酸殘基結(jié)合來(lái)提高肽的穩(wěn)定性和結(jié)合親和力而受到關(guān)注,但仍依賴外部金屬鹽,并且配位鍵的動(dòng)力學(xué)不穩(wěn)定性在復(fù)雜環(huán)境中可能面臨一定挑戰(zhàn)。巰基–烯烴光點(diǎn)擊化學(xué)(Thiol-Ene Photoclick Chemistry)策略結(jié)合了點(diǎn)擊化學(xué)的核心優(yōu)點(diǎn)——快速、高效和操作簡(jiǎn)便,同時(shí)具備光激活的獨(dú)特特性,能夠精確調(diào)控反應(yīng)的空間和時(shí)間。這些獨(dú)到的特性使其在雙環(huán)肽、噬菌體展示雙環(huán)肽文庫(kù)的構(gòu)建和疾病靶標(biāo)活性環(huán)肽篩選中發(fā)揮了關(guān)鍵作用。


圖1. 環(huán)肽雙環(huán)化策略(圖片來(lái)源:Angew. Chem. Int. Ed.

作者首先利用TAIC和N-乙?;?L-半胱氨酸酯作為模型底物,通過(guò)一系列條件優(yōu)化,確定了最佳反應(yīng)條件,并將其拓展到線性多肽的雙環(huán)化上。該反應(yīng)能夠在不同pH條件及不同緩沖鹽溶液中有效進(jìn)行,與傳統(tǒng)的TBMB環(huán)化方法相比,巰基–烯烴光點(diǎn)擊化學(xué)的環(huán)化策略更為高效,僅產(chǎn)生少量由連接子及光引發(fā)劑引起的雜質(zhì)。此外,作者還將此策略拓展至一系列無(wú)保護(hù)的線性多肽肽鏈,驗(yàn)證了該環(huán)化策略在簡(jiǎn)便性和穩(wěn)健性方面的優(yōu)越性。


圖2. 模型肽上的環(huán)化(圖片來(lái)源:Angew. Chem. Int. Ed.


圖3. 環(huán)化底物拓展(圖片來(lái)源:Angew. Chem. Int. Ed.

隨后,作者將這一方法應(yīng)用于噬菌體展示相關(guān)實(shí)驗(yàn)中。首先,通過(guò)MALDI-TOF MS驗(yàn)證了在表達(dá)的融合pIII蛋白上進(jìn)行的環(huán)化反應(yīng)的可靠性。接著,構(gòu)建了一個(gè)包含十個(gè)隨機(jī)氨基酸(CX5CX5C)的噬菌體展示線性肽文庫(kù),并利用巰基–烯烴光點(diǎn)擊化學(xué)進(jìn)行了環(huán)化。針對(duì)疾病相關(guān)靶標(biāo)蛋白CypA,作者進(jìn)行了多輪淘洗,最終通過(guò)二代測(cè)序得到了富集的多肽序列。隨后,利用表面等離子共振(SPR)和生物膜層干涉(BLI)技術(shù),對(duì)富集的兩條線性多肽及其環(huán)肽的親和力進(jìn)行了測(cè)定。結(jié)果表明,環(huán)肽CM1相比線肽M1,具有顯著提高的結(jié)合親和力,達(dá)到364 ± 70 nM,并且展現(xiàn)了較好的穩(wěn)定性,半衰期為463分鐘。為了進(jìn)一步探究CM1與CypA的相互作用,作者使用了15N標(biāo)記的CypA進(jìn)行1H-15N-HSQC NMR滴定實(shí)驗(yàn),結(jié)果顯示CM1結(jié)合于CypA的活性口袋。這些結(jié)果突出了巰基–烯烴光點(diǎn)擊化學(xué)構(gòu)建的雙環(huán)肽在高效且選擇性靶向治療相關(guān)蛋白方面的潛力。


圖4. 巰基–烯烴光點(diǎn)擊化學(xué)的應(yīng)用(圖片來(lái)源:Angew. Chem. Int. Ed.

總結(jié)

本研究首次報(bào)道了光化學(xué)策略應(yīng)用于自由肽和噬菌體展示無(wú)保護(hù)肽的雙環(huán)化。與傳統(tǒng)的TBMB介導(dǎo)的烷基化方法相比,巰基–烯烴光點(diǎn)擊化學(xué)方法在效率、選擇性和控制性方面具有顯著優(yōu)勢(shì),同時(shí)能最小化篩選過(guò)程中的假陽(yáng)性。該方法操作簡(jiǎn)便、可擴(kuò)展,并且與生物系統(tǒng)兼容,使其成為生成多樣化肽庫(kù)和發(fā)現(xiàn)挑戰(zhàn)性蛋白靶標(biāo)及蛋白–蛋白相互作用(PPIs)配體的有力平臺(tái)??傮w而言,本研究突顯了巰基–烯烴光點(diǎn)擊化學(xué)在擴(kuò)展多肽藥物化學(xué)生物學(xué)工具箱方面的巨大潛力。

相關(guān)工作發(fā)表在

Angewandte Chemie International Edition
(DOI: 10.1002/anie.202518628)上,蘭州大學(xué)天然產(chǎn)物化學(xué)全國(guó)重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室博士研究生 明巍 、 楊小琴 為本文共同第一作者, 雷新響 教授為本文通訊作者。上述研究工作得到了國(guó)家自然科學(xué)基金、甘肅省科技重大專項(xiàng)、甘肅省研究生創(chuàng)新之星項(xiàng)目的資助。

歡迎加入雷新響教授課題組攻讀碩士、博士研究生或者從事博士后課題合作探索。平臺(tái)擁有完善的分子生物學(xué)技術(shù)條件、有機(jī)合成設(shè)施及800 MHz核磁共振,島津MALDI-TOF(7090)等實(shí)驗(yàn)條件。請(qǐng)有意者發(fā)送簡(jiǎn)歷和研究小結(jié)至leixx@lzu.edu.cn。)

作者簡(jiǎn)介

通訊作者 雷新響


雷新響,男,博士生導(dǎo)師,藥物化學(xué)專業(yè),博士,現(xiàn)為蘭州大學(xué)萃英特聘三級(jí)教授。畢業(yè)于中國(guó)科學(xué)院成都生物研究所,曾于2010-2011年在耶魯大學(xué)從事mRNA與蛋白質(zhì)相互作用研究工作。曾任中南民族大學(xué)藥學(xué)院副院長(zhǎng)和民族藥學(xué)國(guó)家級(jí)實(shí)驗(yàn)教學(xué)示范中心主任。從事基于核磁共振波譜技術(shù)的藥物分析、天然產(chǎn)物結(jié)構(gòu)鑒定、活性篩選等研究工作?,F(xiàn)講授波譜分析,曾講授化學(xué)生物學(xué)、生物化學(xué)、結(jié)構(gòu)生物學(xué)、藥事管理學(xué)等課程,主持國(guó)家自然科學(xué)基金面上項(xiàng)目及國(guó)際合作等項(xiàng)目。以通訊作者或第一作者在JACS,《德國(guó)應(yīng)用化學(xué)》,《核酸研究》,ACS Nano,ACS Catalysis,Chemical Science,Analytical Chemistry,Organic Letters,Chemical Communication,《歐洲化學(xué)》,《磁共振化學(xué)》等期刊上發(fā)表系列SCI論文。任《Natural Products and Bioprospecting》編委;《Magnetic Resonance Letters》編委。現(xiàn)任中國(guó)化學(xué)會(huì)有機(jī)分析專業(yè)委員會(huì)委員,湖北省藥學(xué)會(huì)理事,湖北省晶體學(xué)會(huì)理事,組織了多次國(guó)際學(xué)術(shù)會(huì)議,在全國(guó)性和國(guó)際性學(xué)術(shù)會(huì)議上做報(bào)告40余次,被Nature,德國(guó)應(yīng)用化學(xué),Nature Communications等期刊邀請(qǐng)為審稿人。

第一作者


明巍 蘭州大學(xué) 博士研究生 藥物化學(xué)生物學(xué)方向


楊小琴 蘭州大學(xué) 博士研究生 藥物化學(xué)生物學(xué)方向

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