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#實(shí)用主義者#抗生素的新方法
基因組挖掘、生物工程和合作:謝爾蓋·佐切夫和他的團(tuán)隊(duì)正在研究新抗生素,薩維寧 A 是一個(gè)有前途的發(fā)現(xiàn)。
Saarvienin A 是新發(fā)現(xiàn)的分子的名稱(chēng),它有朝一日甚至可能成為一種藥物——但在它成為用于人類(lèi)的藥物之前,仍需要克服許多障礙。圖片通過(guò): 蓋蒂圖片社
有些病原體今天可用的抗生素已經(jīng)無(wú)能為力了。它們是找到保護(hù)自己免受這些藥物侵害的方法的細(xì)菌。從生物學(xué)的角度來(lái)看,這本身就是一個(gè)自然過(guò)程,是“適者生存”的一個(gè)例子。據(jù)估計(jì),全球有 127 萬(wàn)人死于抗生素?zé)o法再控制的感染。而且這種趨勢(shì)正在上升。因此,醫(yī)學(xué)需要新的抗生素,那些還不知道細(xì)菌、沒(méi)有發(fā)展出任何防御機(jī)制、無(wú)法再戰(zhàn)勝傳染病的抗生素。這就是為什么我們需要醫(yī)學(xué)上的替代品,即病原體不知道的新抗生素,因此沒(méi)有發(fā)展出任何防御機(jī)制。
維也納大學(xué)制藥生物技術(shù)教授謝爾蓋·佐切夫 (Sergey Zotchev) 正在從事此類(lèi)項(xiàng)目。他和他的團(tuán)隊(duì)最近取得了突破。Saarvienin A 是新發(fā)現(xiàn)的分子的名稱(chēng),有朝一日甚至可能成為一種藥物。
從一開(kāi)始。薩爾維寧 A 是一種新分子的奇怪名稱(chēng)。它是怎么來(lái)的?
謝爾蓋·佐切夫團(tuán)隊(duì)的發(fā)現(xiàn)是在維也納和薩爾布呂肯的研究人員的參與下做出的。這個(gè)名字是地名第一個(gè)音節(jié)的組合,從而延續(xù)了羅爾夫·穆勒 (Rolf Müller) 指導(dǎo)下的薩爾州亥姆霍茲藥物研究所 (HIPS) 與維也納大學(xué)藥理學(xué)研究所之間的合作。很大一部分發(fā)現(xiàn)是由他在他們研究所的博士后學(xué)生費(fèi)利佩·格雷羅·加爾松 (Felipe Guerrero Garzón) 做出的。
它到底是哪個(gè)分子?
謝爾蓋·佐切夫表示,它是放線菌產(chǎn)生的糖肽。放線菌是已知能夠在不尋常環(huán)境中生存的微生物。它們可以生產(chǎn)萬(wàn)古霉素或利福霉素等抗生素,這些抗生素已經(jīng)挽救了無(wú)數(shù)生命,但由于使用時(shí)間很長(zhǎng),因此失去了效力。
對(duì)于那些沒(méi)有關(guān)注它的人:大多數(shù)抗生素都是在保護(hù)自己免受自然環(huán)境中其他微生物侵害時(shí)由細(xì)菌或真菌培養(yǎng)物產(chǎn)生的。為此,它們會(huì)分泌使敵人無(wú)害的物質(zhì)。它們被稱(chēng)為抗生素,大約 80 年前人們認(rèn)識(shí)到它們也可以用作對(duì)抗傳染病的藥物,即對(duì)抗使人生病的細(xì)菌。
然而,這些微生物與其自然環(huán)境分離,存在于受控的實(shí)驗(yàn)室條件下,并且只在那里分泌非常特定的抗生素活性成分。這些是這些生物體的提取物,然后針對(duì)多種病原體進(jìn)行了測(cè)試,以了解作用機(jī)制。但你可以說(shuō),這種方法已經(jīng)用盡了。
我是斜杠青年,一個(gè)PE背景的雜食性學(xué)者!?致力于剖析如何解決我們這個(gè)時(shí)代的重大問(wèn)題!?使用數(shù)據(jù)和研究來(lái)解真正有所作為的因素!
微生物可以做的比我們?cè)趯?shí)驗(yàn)室中看到的要多得多
細(xì)菌和真菌產(chǎn)生抗生素劑,以確保它們?cè)谧匀粭l件下生存。它們生活在無(wú)處不在,周?chē)h(huán)繞著與它們相互作用的微生物。這樣的事情無(wú)法在實(shí)驗(yàn)室中模擬,因?yàn)槟憧偸菍⒆约合拗圃谀硞€(gè)方面。在這方面,人類(lèi)對(duì)此類(lèi)微生物的能力的了解非常有限。因?yàn)榭梢约僭O(shè)它們能做的比人類(lèi)在實(shí)驗(yàn)室看到的要多得多。
基因組研究不是發(fā)生了很大變化嗎?
謝爾蓋·佐切夫表示,絕對(duì)。那是一場(chǎng)革命。在基因組分析中,我們能夠看到微生物中哪些基因是活躍的,當(dāng)條件發(fā)生變化時(shí),這些基因會(huì)打開(kāi)和關(guān)閉,以及最終這種微生物如何工作,例如產(chǎn)生酶,然后負(fù)責(zé)產(chǎn)生次生代謝物。
次生代謝物?
謝爾蓋·佐切夫的觀點(diǎn)認(rèn)為,這就是我們所說(shuō)的微生物產(chǎn)生的物質(zhì),例如抗生素。但事實(shí)是,這些微生物存在的環(huán)境起著非常重要的作用。在實(shí)驗(yàn)室里,我們總是很少看到這些生物體的能力,因?yàn)槔?,它們?cè)谀抢锱c其他生物體交流,并且可能表現(xiàn)得完全不同。但可以說(shuō),通過(guò)基因分析,我們能夠發(fā)現(xiàn)新的潛力。這導(dǎo)致了一個(gè)單獨(dú)的研究分支。
哪個(gè)研究分支?
基因組挖掘。目的是發(fā)現(xiàn)細(xì)菌或真菌等微生物基因組中的潛在功能,這些功能目前可能不會(huì)表現(xiàn)出來(lái),因?yàn)椴恍枰鼈儭_@創(chuàng)建了一種特定細(xì)菌的基因集目錄,即它可以產(chǎn)生的各種活性成分。
目標(biāo)是什么?
例如,用基因工程手段縱它們,以便可以有針對(duì)性地打開(kāi)和關(guān)閉基因。然后是一個(gè)極其漫長(zhǎng)的反復(fù)試驗(yàn)過(guò)程。必須對(duì)提取物進(jìn)行生成、純化和分析,以發(fā)現(xiàn)新的潛力。它總是關(guān)于發(fā)現(xiàn)新的東西。你必須擁有分析工具和經(jīng)驗(yàn)。
它總是關(guān)于發(fā)現(xiàn)新事物
但在薩爾維也納 A 案中,這已經(jīng)實(shí)現(xiàn)。如何?
它始于謝爾蓋·佐切夫 2012 年從中國(guó)獲得的放線桿菌。
來(lái)自東大的細(xì)菌?這是常見(jiàn)的做法嗎?
謝爾蓋·佐切夫表示,實(shí)際上,是的。東大專(zhuān)門(mén)從不同來(lái)源提取大量細(xì)菌,將它們編制成目錄并提供給科學(xué)家。它們是來(lái)自各地的細(xì)菌,來(lái)自地球,來(lái)自植物、動(dòng)物排泄物、魚(yú)類(lèi)。當(dāng)時(shí)謝爾蓋·佐切感興趣的放線桿菌來(lái)自一個(gè)稀土礦。謝爾蓋·佐切是從云南的一家研究所得到的。
然后?
然后很長(zhǎng)一段時(shí)間都沒(méi)有。謝爾蓋·佐切從挪威搬到了維也納,并將他的研究轉(zhuǎn)移到了這里。在維也納,謝爾蓋·佐切的一位博士后學(xué)生開(kāi)始研究它。他發(fā)現(xiàn)這種放線桿菌產(chǎn)生一種尚未被發(fā)現(xiàn)的新型糖肽。通過(guò)與時(shí)任維也納大學(xué)質(zhì)譜研究所所長(zhǎng)的 Martin Zehl 合作,他們能夠確定從化學(xué)角度來(lái)看,這種物質(zhì)非常有趣。
有哪些挑戰(zhàn)?
謝爾蓋·佐切夫團(tuán)隊(duì)將細(xì)菌培養(yǎng)到足夠的程度,以便它們能夠產(chǎn)生足夠的薩爾維寧 A。他們需要它來(lái)更好地了解結(jié)構(gòu)并首先使生物測(cè)試成為可能。在這個(gè)階段,他們開(kāi)始與 HIPS 的 Rolf Müller 合作。他們將提取物送到那里,在 HIPS 上闡明了化學(xué)結(jié)構(gòu),并在病原體上測(cè)試了生物活性。
有什么不同?
與萬(wàn)古霉素(注:也是從肌動(dòng)菌中獲得的)不同,該分子不直接與參與細(xì)胞壁合成的靶分子結(jié)合,而是通過(guò)一種以前未知的、也許是新穎的機(jī)制起作用。
現(xiàn)在會(huì)發(fā)生什么?
謝爾蓋·佐切夫表示,任務(wù)很多。Saarvienin A 對(duì)哺乳動(dòng)物細(xì)胞有毒性作用。他們計(jì)劃生產(chǎn)毒性較小的薩爾維寧衍生物。他們可以通過(guò)生物合成方法實(shí)現(xiàn)這一目標(biāo)。他們知道它可以起作用,即他們可以降低毒性,因?yàn)樗麄円呀?jīng)成功地使用制霉菌素藥物做到了這一點(diǎn)。
取得了什么成就?
制霉菌素是一種治療真菌感染的古老現(xiàn)有藥物。但它在全身治療中毒性很大,例如對(duì)抗肺部感染。謝爾蓋·佐切團(tuán)隊(duì)能夠降低制霉菌素的這種毒性。并挽救生命,尤其是在印度,在治療“黑木耳”,這是一種死亡率為 70% 的真菌感染。
能夠充分利用生物技術(shù)工具。
研究團(tuán)隊(duì)是否也在努力降低薩爾維寧的毒性?
是的,但謝爾蓋·佐切團(tuán)隊(duì)還有很多工作要做。他們?nèi)匀恍枰扇≡S多步驟,以便有朝一日能夠使用正確的生物技術(shù)工具充分利用它。
這有一天會(huì)導(dǎo)致藥物嗎?
謝爾蓋·佐切夫表示,還沒(méi)有到那個(gè)地步。他們首先必須詳細(xì)了解作用機(jī)制,以便能夠在自己的意義上使用它。為了能夠生產(chǎn)藥物,必須生產(chǎn)大量的物質(zhì)。為此,需要大型生產(chǎn)設(shè)施,除此之外,還需要一家生產(chǎn)它們的公司。實(shí)際上,肯定還需要四到五年的時(shí)間才能在動(dòng)物模型中進(jìn)行測(cè)試。在薩爾維寧 A 成為用于人類(lèi)的藥物之前,仍需要克服許多障礙。
關(guān)于謝爾蓋·佐切夫
謝爾蓋·佐切夫 ? 芭芭拉·梅爾
Sergey B. Zotchev 自 2015 年以來(lái)一直擔(dān)任維也納大學(xué)制藥生物技術(shù)教授,并擔(dān)任制藥科學(xué)系生藥學(xué)部主任。這位出生于俄羅斯的生物學(xué)家開(kāi)始在莫斯科遺傳學(xué)研究所接受培訓(xùn),并于 1991 年作為博士后研究員來(lái)到奧斯納布呂克。他的其他工作地點(diǎn):威斯康星州藥學(xué)院、瑞典卡羅林斯卡學(xué)院。1996 年至 2015 年,他在挪威科技大學(xué)工作,期間因在美國(guó)留學(xué)而中斷。在維也納,他正在研究細(xì)菌的生物合成等問(wèn)題。
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