導(dǎo)讀
近期,浙江大學(xué)化學(xué)系丁寒鋒教授團隊基于生源啟發(fā)的末端D環(huán)構(gòu)建思路,采用氧化去芳構(gòu)化引發(fā)(ODI)的(5+2)環(huán)加成/1,2-酰基遷移策略,結(jié)合SmI?介導(dǎo)的頻哪醇偶聯(lián)/Grob裂解/脫氧串聯(lián)反應(yīng),高效構(gòu)建了具有norneoelisabane型骨架的三環(huán)共同中間體?;谠摬呗?,團隊完成了包括elisapterosins A–F、aberrarone、elisabanolide及3-epi-elisabanolide等三大類九個天然產(chǎn)物的全合成。此外,研究還借助計算核磁技術(shù),精準(zhǔn)預(yù)見了elisapterane類天然產(chǎn)物家族成員間化學(xué)結(jié)構(gòu)的罕見突變,成功完成了對elisapterosins A、D和F結(jié)構(gòu)的修正,該結(jié)果最終通過全合成獲得有力驗證。相關(guān)研究成果發(fā)表于《Journal of the American Chemical Society》。
本文工作概述。圖片來源:J. Am. Chem. Soc.
海洋是天然產(chǎn)物的豐富來源,蘊藏著眾多結(jié)構(gòu)復(fù)雜多樣的化合物。這些結(jié)構(gòu)新穎的海洋天然分子長期以來吸引著合成化學(xué)領(lǐng)域的廣泛研究興趣。然而,由于天然來源有限、提取困難,加之其本身結(jié)構(gòu)復(fù)雜,其準(zhǔn)確結(jié)構(gòu)鑒定常常面臨巨大挑戰(zhàn)。文獻中屢見不鮮的結(jié)構(gòu)誤判案例,也為有機化合物的結(jié)構(gòu)解析工作提供了深刻教訓(xùn)。對從事天然產(chǎn)物全合成的化學(xué)家來說,投入大量精力合成一個最終被證明是錯誤的分子結(jié)構(gòu),無疑是令人十分挫敗的經(jīng)歷。
歷史上,曾多次出現(xiàn)通過“枚舉式”全合成系統(tǒng)驗證所有可能結(jié)構(gòu)以修正天然產(chǎn)物真實構(gòu)型的案例。客觀而言,這類方法通常耗費巨大且成功率較低。如今,隨著計算化學(xué)在有機化合物結(jié)構(gòu)鑒定中的應(yīng)用日益成熟,例如,借助計算化學(xué)方法可對有機分子的核磁共振譜這一指紋性信息實現(xiàn)可靠預(yù)測,該方法有望在合成前有效排除錯誤結(jié)構(gòu)。與傳統(tǒng)枚舉合成策略相比,這種計算輔助手段在時間與資源成本上具有明顯優(yōu)勢,并已在多個復(fù)雜天然產(chǎn)物的結(jié)構(gòu)修訂中取得良好效果(圖一)。
此外,并非所有結(jié)構(gòu)存疑的天然產(chǎn)物都適于采用枚舉式全合成進行修正。匯聚式合成策略依賴于可獨立制備并靈活組裝的結(jié)構(gòu)片段,為系統(tǒng)嘗試多種結(jié)構(gòu)變體提供了可能,但對于多環(huán)稠合類分子,實現(xiàn)有效的匯聚式切斷往往較為困難。相應(yīng)地,在線性合成路線中若依賴底物控制實現(xiàn)關(guān)鍵反應(yīng),一旦目標(biāo)分子結(jié)構(gòu)發(fā)生變動,很可能導(dǎo)致原有合成設(shè)計完全失效,需從頭規(guī)劃。
圖一 圖片來源:J. Am. Chem. Soc.
Elisapterane 二萜是由 Rodríguez 等人自Pseudopterogorgia elisabethae (Bayer)中分離得到的一類多環(huán)天然產(chǎn)物(圖二)。目前,該家族已有六個成員陸續(xù)被分離和鑒定,分別為 elisapterosins A–F。初步研究發(fā)現(xiàn),elisapterosin B 對結(jié)核分枝桿菌具有顯著抑制作用。該標(biāo)志性分子引起了多個國際合成團隊的關(guān)注,其全合成研究也推動了一系列精巧策略與方法的發(fā)展。值得注意的是,以往在該類分子的合成中,對于環(huán)系的構(gòu)建順序存在相近的設(shè)計邏輯,即普遍傾向于優(yōu)先構(gòu)筑氧化程度較高的D環(huán)。本研究團隊注意到elisapterane二萜在生源上與aberrarane及elisabane型二萜存在骨架連接方式的關(guān)聯(lián),進而提出了一種推遲構(gòu)建D環(huán)的新策略,旨在通過基于neoelisabane型骨架的通用中間體,實現(xiàn)多個天然產(chǎn)物的發(fā)散式全合成。
圖二 圖片來源:J. Am. Chem. Soc.
基于這一合成思路與課題組的前期工作,研究團隊提出了基于ODI-(5+2) 環(huán)加成/1,2-?;w移及SmI2介導(dǎo)的頻哪醇偶聯(lián)/Grob裂解/去氧兩組串聯(lián)反應(yīng)的逆合成分析(圖三),靶向具有norneoelisabane型骨架的三環(huán)中間體(10)。
圖三 圖片來源:J. Am. Chem. Soc.
在對關(guān)鍵的SmI2介導(dǎo)的重排反應(yīng)的探究中,研究團隊基于對副產(chǎn)物生成的機理分析最終通過微調(diào)底物的方式成功克服了該串聯(lián)反應(yīng)的優(yōu)化,隨后順利制備關(guān)鍵中間體(10)(圖四、圖五),在此基礎(chǔ)上直接完成了aberrarone、elisabanolide及3-epi-elisabanolide的發(fā)散性合成(圖六)。
圖四 圖片來源:J. Am. Chem. Soc.
圖五 圖片來源:J. Am. Chem. Soc.
圖六 圖片來源:J. Am. Chem. Soc.
隨后,課題組以四環(huán)中間體(37)為起點,進一步推進對elisapterane二萜的合成研究。期間,他們發(fā)現(xiàn)天然產(chǎn)物elisapterosin F的原有結(jié)構(gòu)認定可能存在錯誤(圖七)。通過重新審視多個迄今尚未完成合成的、結(jié)構(gòu)更為復(fù)雜的elisapterane二萜(包括elisapterosins A、D、E和F)的原始測試數(shù)據(jù),研究小組首先對分離文獻中關(guān)于C2/C3位立體化學(xué)的指定提出了質(zhì)疑。
圖七 圖片來源:J. Am. Chem. Soc.
研究團隊借助Sarotti小組發(fā)展的ANN-PRA與DP4+,以及中南大學(xué)王文宣團隊建立的STS等核磁計算與分析手段,最終確定elisapterosins A和D中C2位羥基構(gòu)型與分離文獻中原先所提出的結(jié)構(gòu)恰好相反(圖八)。值得注意的是,在elisapterosin E中,原始文獻所推斷的構(gòu)型正確無誤,其C2位羥基的立體化學(xué)與推測結(jié)構(gòu)極其相似的elisapterosin A截然相反。
圖八 圖片來源:J. Am. Chem. Soc.
棘手之處在于,核磁計算顯示elisapterosin F并非簡單的C2/C3差向異構(gòu)體(圖九)。事實上,分離文獻中提供的該分子二維圖譜中,清晰的NOE信號關(guān)聯(lián)也排除了這一可能性。研究團隊一度被這個表面自洽實則矛盾的難題困擾,最終通過細致比對天然與合成樣品之間碳譜數(shù)據(jù)的差異,并借助計算化學(xué)方法進行系統(tǒng)驗證,提出其真實結(jié)構(gòu)應(yīng)為過氧半縮酮(41)。
圖九 圖片來源:J. Am. Chem. Soc.
根據(jù)計算修正后的結(jié)構(gòu),研究團隊首要任務(wù)是對elisapterosins B和C進行烯醇氧化條件的篩選,以期實現(xiàn)β-立體選擇性控制。幸運的是,他們發(fā)現(xiàn)苯亞硒酸酐可作為有效的氧化試劑,并由此完成了elisapterosins A和D的合成(圖十)。另一方面,借助于在研究過程中偶然發(fā)現(xiàn)的兩個由分子內(nèi)氫原子轉(zhuǎn)移(HAT)介導(dǎo)的C17位羥基氧化途徑,團隊順利實現(xiàn)了elisapterosins E和F的全合成(圖十一)。至此,計算化學(xué)所預(yù)見的特殊結(jié)構(gòu)變異成功指引了合成路線的設(shè)計,并最終獲得實驗結(jié)果的充分支持。研究團隊也對通過類比和比較的方式推測有機化合物結(jié)構(gòu)的做法提出了警示,因其不可避免帶有研究者的主觀判斷。
圖十 圖片來源:J. Am. Chem. Soc.
圖十一 圖片來源:J. Am. Chem. Soc.
該研究在丁寒鋒教授指導(dǎo)下完成;浙江大學(xué)化學(xué)系博士生劉春慧及碩士生龔涵為該論文共同第一作者,完成了主要的實驗工作;浙江大學(xué)化學(xué)系博士生夏啟東為論文的共同通訊作者,完成了天然產(chǎn)物結(jié)構(gòu)修正等理論計算工作。本研究得到了國家自然科學(xué)基金的資助。謹以此研究致浙江大學(xué)化學(xué)系成立110周年。
原文鏈接:https://pubs.acs.org/doi/10.1021/jacs.5c11010
丁寒鋒課題組主頁:
https://person.zju.edu.cn/ding
來源:浙江大學(xué)化學(xué)系
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