癌癥本質(zhì)上是空間和時(shí)間上具有高度異質(zhì)性的細(xì)胞群，這種異質(zhì)性產(chǎn)生的根本在于——克隆進(jìn)化。在遺傳和表觀遺傳突變的驅(qū)動(dòng)下，癌細(xì)胞會(huì)形成復(fù)雜且表型可塑的亞克隆，為了適應(yīng)不同的內(nèi)外環(huán)境挑戰(zhàn)，各細(xì)胞亞克隆在癌癥進(jìn)化（cancer evolution）過程中發(fā)生自然擴(kuò)張或收縮。癌癥的高異質(zhì)性最終決定了患者的臨床表現(xiàn)、對(duì)治療的應(yīng)答程度以及預(yù)后差異。面對(duì)癌癥治療中出現(xiàn)的轉(zhuǎn)移、耐藥和復(fù)發(fā)等挑戰(zhàn)，深入了解癌癥的進(jìn)化本質(zhì)已成為解決這些問題的關(guān)鍵。

為了理解癌癥進(jìn)化，腫瘤系統(tǒng)發(fā)育學(xué)應(yīng)運(yùn)而生。腫瘤系統(tǒng)發(fā)育學(xué)借助物種進(jìn)化的理論框架，通過深入分析遺傳變異來構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育樹，從而可視化癌癥進(jìn)化過程。腫瘤進(jìn)化的研究方法通常需要依賴細(xì)胞譜系追蹤和單細(xì)胞測(cè)序，有著普通實(shí)驗(yàn)室根本開展不了此類研究的缺點(diǎn)：較高的技術(shù)準(zhǔn)入壁壘，且費(fèi)用高昂。

近日，湖北醫(yī)藥學(xué)院欽閃閃研究團(tuán)隊(duì)在期刊Experimental & Molecular Medicine 發(fā)表了題為EHBMT, a method for visualizing tumor evolution, identifies a surge in gastric cancer with hybrid epithelial–mesenchymal phenotypes due to an inflammatory microenvironment研究論文（Method Article），正式推出一種原創(chuàng)性的腫瘤進(jìn)化可視化方法——EHBMT（A EMT Heterogeneity-Based Molecular Typing method），為上述難題提供了高效、經(jīng)濟(jì)且普適的新解決方案。

EHBMT是首個(gè)基于bulk轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)可視化腫瘤進(jìn)化的研究方法。該方法創(chuàng)新性地以上皮-間質(zhì)轉(zhuǎn)化（Epithelial-Mesenchymal Transition, EMT）程序的異質(zhì)性、可塑性和保守性為核心切入點(diǎn)，通過分子分型將配對(duì)的癌和癌旁組織區(qū)分為上皮表型簇（EPC）、混合上皮-間質(zhì)表型簇（HPC）和間質(zhì)表型簇（MPC）三個(gè)亞型，從而組織構(gòu)建出能夠反映腫瘤進(jìn)化狀態(tài)的分子分型體系。與經(jīng)典/傳統(tǒng)腫瘤進(jìn)化研究方法相比，EHBMT具有較高的創(chuàng)新性、準(zhǔn)確性，且經(jīng)濟(jì)實(shí)惠、易于操作。鑒于大多數(shù)惡性腫瘤為上皮來源，EHBMT方法在絕大多數(shù)腫瘤類型中均具有良好的適用性和應(yīng)用潛力。

以胃癌為例，我們發(fā)現(xiàn)不同的EHBMT胃癌亞型在具有截然不同的增殖能力、分子特征和臨床結(jié)局。腫瘤進(jìn)化可視化分析結(jié)果發(fā)現(xiàn)，HPC亞型在胃癌進(jìn)化中出現(xiàn)明顯擴(kuò)增。具體而言，約有70-80%的正常EPC亞型病例最終進(jìn)化為HPC/MPC亞型胃癌，提示EMT信號(hào)通路在胃癌中普遍異常激活。進(jìn)一步分析提示，炎性腫瘤微環(huán)境，尤其是關(guān)鍵炎癥因子IL-1β的持續(xù)激活，可能是驅(qū)動(dòng)正常EPC亞型胃組織向HPC/MPC亞型胃癌組織轉(zhuǎn)變的關(guān)鍵因素。值得一提的是，上述基于EHBMT的胃癌進(jìn)化可視化結(jié)果，已得到多色免疫熒光染色和單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組分析的雙重驗(yàn)證。

綜上所述，EHBMT方法不僅為腫瘤進(jìn)化研究領(lǐng)域的科研人員提供了一種操作簡(jiǎn)便、成本低廉且可推廣性強(qiáng)的腫瘤進(jìn)化可視化工具，有助于降低該領(lǐng)域的技術(shù)門檻；同時(shí)，由于上皮-間質(zhì)轉(zhuǎn)化（EMT）與腫瘤侵襲、轉(zhuǎn)移及治療耐藥等關(guān)鍵生物學(xué)過程密切相關(guān)，該方法也為深入解析EMT在腫瘤進(jìn)化中的動(dòng)態(tài)作用提供了全新的視角和研究范式，有望推動(dòng)腫瘤可塑性與克隆演化機(jī)制的進(jìn)一步探索。

湖北醫(yī)藥學(xué)院欽閃閃教授、冷衛(wèi)東教授是上述論文通訊作者；李丹丹教授、周增博士是論文共同第一作者。湖北醫(yī)藥學(xué)院為唯一通訊單位。此外，就EHBMT腫瘤進(jìn)化可視化方法的臨床應(yīng)用價(jià)值，欽閃閃團(tuán)隊(duì)已申請(qǐng)發(fā)明專利1項(xiàng)（2025112334092）。

原文鏈接： https://www.nature.com/articles/s12276-025-01570-6

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